1、保守治疗多采用假孕或假绝经疗法：

如达哪唑和三苯氧胺、内美通、普维拉等，人为的造成月经停止来潮形成假孕状态，不来月经就没有痛经，但该类药副作用较大，并对肝肾有一定的损害，一些病人当病尚未治愈但由于副作用，只得停药，停药后月经仍会来潮，病情一般会继续发展。

2、手术治疗分两种：

（1）根治性手术，即将两侧卵巢和子宫全部切除，这对年轻和未生育的妇女是极其残酷的，所引起的并发症、后遗症给患者身心造成一定的痛苦，术后会发生绝经期综合症。

（2）保守性手术，将病变部位局部切除、剥离、剔除，但由于该病粘连很重，往往手术不彻底，如已经异位到骶韧带，侵润到直肠的异位病灶电灼后，复发率高。

腹腔镜即是一种诊断方法，又可以进行治疗，但术后复发机会较多，目前西医对子宫内膜异位症确诊较轻易， 但治疗上也很棘手。

子宫内膜异位症手术难于治愈，术后又易于复发，因此，药物治疗仍占据重要地位。药物治疗可分为术前用药或术后用药。术前用药可缩小病灶、缩小子宫、减轻盆腔粘连及充血、抑制卵巢生理性囊肿的生成，对腹腔镜手术应该有利。

目前内异症药物治疗多为术前及术后用药，术后用药可减灭残余病灶、推迟内异症复发。主要适合于异位病灶广泛、未能彻底切除者或肉眼所见异位病灶已被清除，但无生育要求的有疼痛症状者。国外发表的循证医学资料表明，对有疼痛症状的患者在腹腔镜保守性手术后再用药治疗以6个月为宜。对肉眼所见异位病灶已被清除，希望近期生育者可鼓励患者尽早怀孕。

治疗内异症常用而有效的药物有达那唑、孕三烯酮、促性腺激素释放激素类似物或激动剂 、孕激素类药物及口服避孕药物等。循证医学资料表明，上述药物治疗内异症的疗效相差不大，然而副作用各不相同，价格也有很大差异。因此，在选择用药时应与患者充分交流沟通，共同制定治疗方案。